Die Unterschlüpfe sind sehr wichtig für Helden und Schurken. Die Helden sind in Gotham City Police Departments(GCPD) und Metropolis Police Departments(MPD) zu finden, die Schurken in Nachtclubs wie Lexcellence.
Hier findet ihr folgendes:
- einen Teleporter zur Halle des Schreckens bzw. zum Wachturm
- die Postfächer
- Booster Gold-Erkundungsabenteuer-Kioske
- sowie diverse Charaktere, die euch mit Missionen beauftragen
In jeweils einem Unterschlupf in Gotham City und Metropolis findet ihr auch eine F&E - Werkbank, sowie F&E - Händler.
GCPDs findet ihr - wie der Name schon sagt - in Gotham. Eines findet ihr im East End(GCPD 3.Bezirk), das andere im Diamond District(GCPD 12.Bezirk). Die MPDs befinden sich in Chinatown, Little Bohemia und Stadtmitte.
Die Nachtclubs in Gotham sind in North Burnley(Tap Room) und in Burnley(Club 531). In Metropolis befinden sich die Nachtclubs in Chinatown(Sheeda's Den), Stadtmitte(Club de Ville) und in Little Bohemia(Lexcellence).